Lietuvos gastroenterologų draugija yra šių tarptautinių organizacijų narė:
- www.ueg.eu Jungtinės Europos Gastroenterologijos (United European Gastroenterology (UEG)) organizacija. UEG yra ne pelno siekianti organizacija, vienijanti Europos sveikatos priežiūros specialistus ir nacionalines organizacijas, kurių domėjimosi sritis – virškinimo sistemos sveikata.
- www.worldgastroenterology.org/ Pasaulio Gastroenterologijos organizacija (World Gastroenterology Organisation (WGO)) .
- www.easl.eu Europos Kepenų Tyrimų asociacija (The European Association for the Study of the Liver (EASL)).
- www.esdo.eu Europos virškinimo organų onkologijos draugija (European Society of Digestive Oncology (ESDO)).
Lietuvos gastroenterologų draugija glaudžiai bendradarbiauja su su šiomis draugijomis:
- Kauno gastroenterologijos ir endoskopijos klubas.
- http://lcha.lt/lt/ Lietuvos chirurgų asociacija.
- www.endoskopija.lt Lietuvos endoskopuotojų draugija.
- https://www.lpemd.org/ Lietuvos parenterinės ir enterinės mitybos draugija.
- www.lid.lt/ Lietuvos infektologų draugija.